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| Registros recuperados : 102 | |
| 61. |  | MONTOSSI, F.; DE BARBIERI, I.; LUZARDO, S.; NOLLA, M.; PLATERO, P.; RODRÍGUEZ, A.; ARMAND,UGON, R.; ROVIRA, F.; MARTÍNEZ, H.; FRUGONI, J.C.; LEVRATTO, J.; DUTRA, F.; VIÑOLES, C.; BANCHERO, G.; QUINTANS, G.; MEDEROS, A.; SAN JULIÁN, R.; MANTECA, X. Estrategias de alimentación y manejo de ovejas melliceras. ln: INIA TACUAREMBÓ. ESTACIÓN EXPERIMENTAL GLENCOE. Día de campo. Producción animal, pasturas y forestal. Estación Experimental Glencoe, Paysandú, octubre, 2005. Tacuarembó (Uruguay): INIA, 2005. p. 35-36 (INIA Serie Actividades de Difusión ; 431)| Biblioteca(s): INIA Tacuarembó. |
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| 62. | | MONTOSSI, F.; DE BARBIERI, I.; MEDEROS, A.; CIAPPESONI, G.; FRUGONI, J.C.; MARTÍNEZ, H.; LUZARDO, S.; NOLLA, M.; LEVRATTO, J.; GRATTAROLA, M.; PÉREZ JONES, J.; FROS, A. Núcleo fundacional del Proyecto Merino Fino del Uruguay: resultados obtenidos (1999 - 2005). ln: INIA Tacuarembó. Unidad Experimental Glencoe. Proyecto Merino Fino del Uruguay: sexta distribución de carneros generados en el núcleo fundacional de merino fino de la Unidad Experimental Glencoe, INIA Tacuarembó, 1999 - 2005. 16 diciembre, Glencoe, Paysandú, 2005. Tacuarembó (Uruguay): INIA, 2005. p.75-94 (INIA Serie Actividades de Difusión ; 439)| Biblioteca(s): INIA Tacuarembó. |
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| 63. | | MONTOSSI, F.; DE BARBIERI, I.; MEDEROS, A.; DE MATTOS, D.; FRUGONI, J.C.; MARTÍNEZ, H.; NOLLA, M.; DIGHIERO, A.; ZAMIT, W.; LEVRATTO, J.; LUZARDO, S.; GRATTAROLA, M.; PÉREZ JONES, J.; FROS, A. Núcleo fundacional del Proyecto Merino Fino del Uruguay: resultados obtenidos (1999-2003). ln: INIA Tacuarembó. Sociedad Criadores Merino Australiano del Uruguay. SUL. Proyecto Merino Fino del Uruguay: cuarta distribución de carneros generados en el Núcleo Fundacional de Merino Fino de la la Unidad Experimental Glencoe, 1999 - 2003. Glencoe, Paysandú, 10 de diciembre, 2003. Tacuarembó (Uruguay): INIA, 2003. p. 30-50 (INIA Serie Actividades de Difusión ; 343)| Biblioteca(s): INIA Tacuarembó. |
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| 64. | | MONTOSSI, F.; DE BARBIERI, I.; NOLLA, M.; MEDEROS, A.; CIAPPESONI, G.; FRUGONI, J.C.; MARTÍNEZ, H.; DIGHIERO, A.; ZAMIT, W.; LEVRATTO, J.; LUZARDO, S.; GRATTAROLA, M.; PÉREZ JONES, J.; FROS, A. Núcleo Fundacional del Proyecto Merino Fino del Uruguay: resultados obtenidos (1999-2004). ln: INIA Tacuarembó. Sociedad Criadores Merino Australiano del Uruguay. SUL. Proyecto Merino Fino del Uruguay: quinta distribución de carneros generados en el núcleo fundacional de merino fino de la Unidad Experimental Glencoe, INIA Tacuarembó, 1999 - 2004. Glencoe, Paysandú, 10 diciembre, 2004. Tacuarembó (Uruguay): INIA, 2004. p. 37-53 (INIA Serie Actividades de Difusión ; 392)| Biblioteca(s): INIA Tacuarembó. |
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| 65. | | MONTOSSI, F.; DE BARBIERI, I.; NOLLA, M.; MEDEROS, A.; CIAPPESONI, G.; LUZARDO, S.; RAVAGNOLO, O.; RAVAGNOLO, O.; ZENI, M.; GIMENO, D.; PÉREZ JONES, J.; FROS, A.; FRUGONI, J.C.; MARTINEZ, H.; BENTANCURT, M.; ROVIRA, F.; ARMAND,UGON, R.; LEVRATTO, J.; ZAMIT, W. Proyecto Merino Fino del Uruguay: fase I ln: INIA TACUAREMBÓ. ESTACIÓN EXPERIMENTAL GLENCOE. Día de campo. Producción animal, pasturas y forestal. Estación Experimental Glencoe, Paysandú, octubre, 2005. Tacuarembó (Uruguay): INIA, 2005. p. 56-58 (INIA Serie Actividades de Difusión ; 431) INIA Tacuarembó. Unidad Experimental Glencoe| Biblioteca(s): INIA Tacuarembó. |
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| 66. | | MONTOSSI, F.; DE BARBIERI, I.; SAN JULIÁN, R.; DE MATTOS, D.; MEDEROS, A.; DE LOS CAMPOS, G.; DIGHIERO, A.; FRUGONI, J.C.; ZAMIT, W.; LEVRATTO, J.; MARTÍNEZ, H.; GRATTAROLA, M.; PÉREZ JONES, J. Núcleo fundacional del Proyecto Merino Fino del Uruguay: resultados obtenidos. ln: INIA Tacuarembó. Proyecto Merino Fino del Uruguay: segunda distribución de carneros generados en el núcleo fundacional de merino fino de la Unidad Experimental Glencoe, INIA Tacuarembó, 1999 - 2001. Tacuarembó (Uruguay): INIA, 2001. p. 2-19 (INIA Serie Actividades de Difusión ; 273)| Biblioteca(s): INIA Tacuarembó. |
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| 67. | | MONTOSSI, F.; DE BARBIERI, I.; SAN JULIÁN, R.; DE MATTOS, D.; MEDEROS, A.; DE LOS CAMPOS, G.; DIGHIERO, A.; FRUGONI, J.C.; ZAMIT, W.; LEVRATTO, J.; MARTÍNEZ, H.; GRATTAROLA, M.; PÉREZ JONES, J.; FROS, O.A. Núcleo fundacional del Proyecto Merino Fino del Uruguay: resultados obtenidos (1999-2002). ln: INIA TACUAREMBÓ. SOCIEDAD CRIADORES MERINO AUSTRALIANO DEL URUGUAY. Proyecto Merino Fino del Uruguay: tercera distribución de carneros generados en el núcleo fundacional de merino fino de la Unidad Experimental Glencoe, INIA Tacuarembó, 1999 - 2002. Paysandú, 12 diciembre 2002. Tacuarembó (Uruguay): INIA, 2002. p. 8-24 (INIA Serie Actividades de Difusión ; 305)| Biblioteca(s): INIA Tacuarembó. |
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| 68. | | MONTOSSI, F.; DE MATTOS, D.; SAN JULIÁN, R.; DE LOS CAMPOS, G.; MEDEROS, A.; FRUGONI, J.C.; ZAMIT, W.; LEVRATTO, J.; MARTÍNEZ, H.; DE BARBIERI, I.; GRATTAROLA, M.; PÉREZ JONES, J. Núcleo fundacional del Proyecto Merino Fino del Uruguay. ln: INIA Tacuarembó; Unidad Experimental Glencoe. Producción animal y pasturas en Basalto. Día de campo, 15 noviembre, Paysandú, 2001. Tacuarembó (Uruguay): INIA, 2001. p. 12-14 (INIA Serie Actividades de Difusión ; 271)| Biblioteca(s): INIA Tacuarembó. |
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| 69. | | MONTOSSI, F.; LUZARDO, S.; DIGHIERO, A.; DE BARBIERI, I.; NOLLA, M.; MEDEROS, A.; SILVEIRA, C.; GONZALEZ, J.; ROVIRA, F.; ZAMIT, W.; COSTALES, J.; LEVRATTO, J.; MARTINEZ, H. Crecimiento estival de corderos: 1. Efecto de diferentes proporciones de pastura y grano en la dieta de corderas cruzas sobre la producción y calidad de carne ovina. ln: INIA TACUAREMBÓ. ESTACIÓN EXPERIMENTAL GLENCOE. Día de campo. Producción animal, pasturas y forestal. Estación Experimental Glencoe, Paysandú, octubre, 2005. Tacuarembó (Uruguay): INIA, 2005. p. 3-4 (INIA Serie Actividades de Difusión ; 431)| Biblioteca(s): INIA Tacuarembó. |
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| 70. | | MONTOSSI, F.; RISSO, D.; BERRETTA, E.J.; LEVRATTO, J.; RODRIGUEZ MOTTA, J.P. Uso estratégico de avenas en la recría. In: INIA TACUAREMBÓ. UNIDAD EXPERIMENTAL GLENCOE. JORNADA, 27 DE OCTUBRE, PAYSANDÚ, 1994. Pasturas y producción animal en basalto. Tacuarembó, Uruguay: INIA, 1994. p. 23-32 (INIA Serie Actividades de Difusión ; 37)| Biblioteca(s): INIA Tacuarembó. |
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| 71. | | MONTOSSI, F.; RISSO, D.; DE BARBIERI, I.; CUADRO, R.; MEDEROS, A.; LUZARDO, S.; ROVIRA, F.; ALTIERI, Y.; ARMAND,UGON, R.; BENTANCURT, M.; LEVRATTO, J.; ZAMIT, W.; COSTALES, J.; LIMA, G. Efecto de la carga, suplementación y género sobre la recría y el engorde estival de corderos en una mezcla de achicoria y trébol rojo. ln: INIA TACUAREMBÓ. ESTACIÓN EXPERIMENTAL GLENCOE. Día de campo. Producción animal, pasturas. Estación Experimental Glencoe, Paysandú, 14 noviembre, 2006. Tacuarembó (Uruguay): INIA, 2006. (INIA Serie Actividades de Difusión ; 473)| Biblioteca(s): INIA Tacuarembó. |
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| 72. | | MONTOSSI, F.; SAN JULIÁN, R.; BERRETTA, E.J.; FERREIRA, G.; RISSO, D.; ZAMIT, W.; LEVRATTO, J. Producción de carne ovina en sistemas ganaderos. ln: INIA Tacuarembó. Mejoramiento de campos en Cristalino. Escuela Agraria "La Carolina", 20 de noviembre, 2004. Tacuarembó (Uruguay): INIA, 1997. p. 33-39 (INIA Serie Actividades de Difusión ; 153)| Biblioteca(s): INIA Tacuarembó. |
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| 74. | | MONTOSSI, F.; SAN JULIÁN, R.; DE BARBIERI, I.; BERRETTA, E.J.; RISSO, D.; MEDEROS, A.; DIGHIERO, A.; DE MATTOS, D.; ZAMIT, W.; MARTÍNEZ, H.; LEVRATTO, J.; LIMA, G.; COSTALES, J.; CUADRO, R. Alternativas tecnológicas de alimentación y manejo para mejorar la eficiencia reproductiva ovina en sistemas ganaderos. ln: INIA TACUAREMBÓ. INIA TREINTA Y TRES. PROGRAMA NACIONAL OVINOS Y CAPRINOS. PROGRAMA NACIONAL BOVINOS PARA CARNE. Seminario de Actualización Técnica sobre Cría y Recría Ovina y Vacuna, Tacuarembó, 2002. Tacuarembó (Uruguay): INIA, 2002. p. 33-46 (INIA Serie Actividades de Difusión ; 288)| Biblioteca(s): INIA Tacuarembó. |
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| 75. | | MONTOSSI, F.; SAN JULIÁN, R.; DE BARBIERI, I.; NOLLA, M.; DE BARBIERI, I.; ARREDONDO, C.; HELGUERA, L.; LUZARDO, S.; GUERRA, H.; OSPINA, H.; BENTANCURT, M.; ALTIERI, Y.; DA SILVA, D.; LEVRATTO, J.; COSTALES, J. Suplementación en engorde de corderos. ln: INIA TACUAREMBÓ. ESTACIÓN EXPERIMENTAL GLENCOE. Día de campo. Producción animal, pasturas y forestal. Estación Experimental Glencoe, Paysandú, octubre, 2005. Tacuarembó (Uruguay): INIA, 2005. p. 8-10 (INIA Serie Actividades de Difusión ; 431)| Biblioteca(s): INIA Tacuarembó. |
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| 76. | | MONTOSSI, F.; SAN JULIÁN, R.; DE BARBIERI, I.; NOLLA, M.; MEDEROS, A.; LUZARDO, S.; FRANCO, R.; GUTIERREZ, D.; DA SILVA, D.; LEVRATTO, J.; MARTINEZ, H.; BENTANCURT, M.; COSTALES, J. Crecimiento estival de corderos: 2. Alternativas tecnológicas de producción de carne ovina de calidad durante el período estival en la región de Basalto: efecto de la carga animal, sexo y la suplementación con concentrados en corderos pastoreando una pastura de Lotus corniculatus cv. INIA Draco. ln: INIA TACUAREMBÓ. ESTACIÓN EXPERIMENTAL GLENCOE. Día de campo. Producción animal, pasturas y forestal. Estación Experimental Glencoe, Paysandú, octubre, 2005. Tacuarembó (Uruguay): INIA, 2005. p. 4-7 (INIA Serie Actividades de Difusión ; 431)| Biblioteca(s): INIA Tacuarembó. |
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| 77. | | MONTOSSI, F.; SAN JULIÁN, R.; DE MATTOS, D.; BERRETTA, E.J.; RÍOS, M.; ZAMIT, W.; LEVRATTO, J. Alimentación y manejo de la oveja de cría durante el último tercio de gestación en la región de Basalto OVINOS In: BERRETTA, E.J. (Ed.). Seminario de actualización en tecnologías para basalto. INIA Tacuarembó, 3-4 diciembre 1998. Montevideo (Uruguay): INIA, 1998. p. 195-208 (INIA Serie Técnica ; 102) INIA Tacuarembó| Biblioteca(s): INIA La Estanzuela; INIA Las Brujas; INIA Tacuarembó. |
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| 80. | | MONTOSSI, F.; SAN JULIÁN, R.; DE MATTOS, D.; BERRETTA, E.J.; ZAMIT, W.; LEVRATTO, J.; RÍOS, M. Majada de cría: manejo de la oveja de cría durante el último tercio de gestación ln: INIA TACUAREMBÓ. UNIDAD EXPERIMENTAL GLENCOE. JORNADA, OCTUBRE 2000, TACUAREMBÓ. Producción animal y pasturas en basalto. Tacuarembó (Uruguay): INIA, 2000. p. 20-21 (INIA Serie Actividades de Difusión ; 239)| Biblioteca(s): INIA Tacuarembó. |
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| Registros recuperados : 102 | |
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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
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Fecha actual : |
13/11/2015 |
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Actualizado : |
09/10/2019 |
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Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Internacionales |
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Circulación / Nivel : |
Internacional - -- |
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Autor : |
GARAYCOCHEA, S.; SPERANZA, P.; ALVAREZ-VALIN, F. |
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Afiliación : |
SILVIA RAQUEL GARAYCOCHEA SOLSONA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay. |
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Título : |
A strategy to recover a high-quality, complete plastid sequence from low-coverage whole-genome sequencing. |
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Fecha de publicación : |
2015 |
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Fuente / Imprenta : |
Applications in Plant Sciences, 2015, v.3, no.10, Article number 1500022. OPEN ACCESS |
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ISSN : |
2168-0450 |
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DOI : |
10.3732/apps.1500022 |
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Idioma : |
Inglés |
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Notas : |
Article history: First published: 12 October 2015.
The authors thank Fabián Capdeville for his important support at the beginning of this work. This project received financial support from the Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria (INIA), Uruguay. S.G. was the recipient of a Master's degree fellowship awarded by Agencia Nacional de Investigación e Innovación (ANII), Uruguay. F.A.?V. and P.S. are researchers from Sistema Nacional de Investigadores (ANII, Uruguay). |
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Contenido : |
ABSTRACT.
Premise of the study: We developed a bioinformatic strategy to recover and assemble a chloroplast genome using data derived from low-coverage 454 GS FLX/Roche whole-genome sequencing. Methods: A comparative genomics approach was applied to obtain the complete chloroplast genome from a weedy biotype of rice from Uruguay. We also applied appropriate filters to discriminate reads representing novel DNA transfer events between the chloroplast and nuclear genomes. Results: From a set of 295,159 reads (96 Mb data), we assembled the chloroplast genome into two contigs. This weedy rice was classified based on 23 polymorphic regions identified by comparison with reference chloroplast genomes. We detected recent and past events of genetic material transfer between the chloroplast and nuclear genomes and estimated their occurrence frequency. Discussion: We obtained a high-quality complete chloroplast genome sequence from low-coverage sequencing data. Intergenome DNA transfer appears to be more frequent than previously thought.
© 2015 Garaycochea et al. Published by the Botanical Society of America. This work is licensed under a Creative Commons Attribution License (CC-BY-NC-SA). |
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Palabras claves : |
Bioinformatic methods; BIOINFORMÁTICA; Chloroplast genome; Next-generation; Sequencing; Weedy rice. |
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Thesagro : |
ARROZ; BIOLOGÍA; CIENCIA DE INFORMACIÓN; ORYZA SATIVA. |
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Asunto categoría : |
F30 Genética vegetal y fitomejoramiento |
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URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/5184/1/Garaycochea-S.-2015.-Applications-in-plant-Sciences.pdf
https://bsapubs.onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.3732/apps.1500022
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Marc : |
LEADER 02579naa a2200301 a 4500
001 1053875
005 2019-10-09
008 2015 bl uuuu u00u1 u #d
022 $a2168-0450
024 7 $a10.3732/apps.1500022$2DOI
100 1 $aGARAYCOCHEA, S.
245 $aA strategy to recover a high-quality, complete plastid sequence from low-coverage whole-genome sequencing.$h[electronic resource]
260 $c2015
500 $aArticle history: First published: 12 October 2015. The authors thank Fabián Capdeville for his important support at the beginning of this work. This project received financial support from the Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria (INIA), Uruguay. S.G. was the recipient of a Master's degree fellowship awarded by Agencia Nacional de Investigación e Innovación (ANII), Uruguay. F.A.?V. and P.S. are researchers from Sistema Nacional de Investigadores (ANII, Uruguay).
520 $aABSTRACT. Premise of the study: We developed a bioinformatic strategy to recover and assemble a chloroplast genome using data derived from low-coverage 454 GS FLX/Roche whole-genome sequencing. Methods: A comparative genomics approach was applied to obtain the complete chloroplast genome from a weedy biotype of rice from Uruguay. We also applied appropriate filters to discriminate reads representing novel DNA transfer events between the chloroplast and nuclear genomes. Results: From a set of 295,159 reads (96 Mb data), we assembled the chloroplast genome into two contigs. This weedy rice was classified based on 23 polymorphic regions identified by comparison with reference chloroplast genomes. We detected recent and past events of genetic material transfer between the chloroplast and nuclear genomes and estimated their occurrence frequency. Discussion: We obtained a high-quality complete chloroplast genome sequence from low-coverage sequencing data. Intergenome DNA transfer appears to be more frequent than previously thought. © 2015 Garaycochea et al. Published by the Botanical Society of America. This work is licensed under a Creative Commons Attribution License (CC-BY-NC-SA).
650 $aARROZ
650 $aBIOLOGÍA
650 $aCIENCIA DE INFORMACIÓN
650 $aORYZA SATIVA
653 $aBioinformatic methods
653 $aBIOINFORMÁTICA
653 $aChloroplast genome
653 $aNext-generation
653 $aSequencing
653 $aWeedy rice
700 1 $aSPERANZA, P.
700 1 $aALVAREZ-VALIN, F.
773 $tApplications in Plant Sciences, 2015$gv.3, no.10, Article number 1500022. OPEN ACCESS
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Esconder MarcPresentar Marc Completo |
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Registro original : |
INIA Las Brujas (LB) |
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